Dirigido por José A. Seoane, el Grupo de Biología Computacional del Cáncer de VHIO aprovecha grandes conjuntos de datos genéticos y epigenéticos del cáncer para esclarecer los mecanismos moleculares que subyacen al inicio y la progresión tumoral, la resistencia a los fármacos y la metástasis, con el objetivo final de mejorar los resultados de los pacientes.

Nuestra investigación se centra en definir el papel de los elementos reguladores de la cromatina en la respuesta al tratamiento y la progresión metastásica, identificar opciones terapéuticas basadas en la letalidad sintética epigenética, mejorar la estratificación de pacientes mediante análisis multi-ómicos integradores y descubrir nuevos biomarcadores epigenéticos de respuesta terapéutica. Previamente hemos demostrado cómo los modificadores genéticos de la estructura de la cromatina se asocian con la resistencia a la quimioterapia en cáncer de mama (Seoane et al., 2019), y seguimos investigando cómo las alteraciones epigenéticas impulsan la resistencia a los fármacos y cómo las terapias epigenéticas pueden aprovecharse para reactivar las vías supresoras de tumores.

En paralelo, desarrollamos enfoques de aprendizaje automático para la integración horizontal y vertical de conjuntos de datos multi-ómicos, con el fin de descubrir subgrupos de cáncer no reconocidos previamente, identificar biomarcadores predictivos y mejorar la predicción de los resultados del tratamiento y la respuesta a los fármacos. Además, estamos avanzando en metodologías epigenéticas para inferir exposiciones ambientales pasadas a partir de muestras tumorales.

El grupo contribuye activamente a múltiples esfuerzos colaborativos internacionales, incluidos The Cancer Genome Atlas, Human Tumor Atlas Network, Cancer Target Discovery and Development (CTD²) Network y, más recientemente, AURORA, una cohorte multi-ómica de cáncer de mama metastásico, lo que refuerza su compromiso con el descubrimiento basado en datos y el impacto traslacional.