Combinar la firma de expresión génica VIGex con biopsia líquida mejora la predicción de la respuesta a inmunoterapia

VIGEX UITM

Investigadores del Grupo de Genómica del Cáncer y de la Unidad de Investigación en Terapia Molecular del Cáncer UITM-CaixaResearch del VHIO han publicado un estudio en la revista JCO Precision Oncology que concluye que analizar el nivel de inflamación del tumor con la firma de expresión génica inmunitaria VIGex y el ADN tumoral circulante a través de biopsia líquida mejora la predicción de la respuesta a inmunoterapia en pacientes con tumores sólidos avanzados en el contexto de ensayos clínicos.

Esta investigación ha sido posible gracias al apoyo de la Sociedad Española de Oncología médica (SEOM), CRIS contra el cáncer, la Fundación BBVA a través de los Programas CAIMI I y II, la Fundación “la Caixa”, la Fundación FERO a través del Programa DIAMAV, y a un premio de la Universidad de Toronto y el Princess Margaret Cancer Centre de Toronto (Canadá).

Biomarcadores e inmunoterapia

La inmunoterapia se basa en estimular la propia respuesta inmunitaria del paciente contra las células del tumor y ha supuesto una revolución en el tratamiento del cáncer en los últimos años. “Sin embargo, esta estrategia terapéutica no funciona en todos los pacientes ni en todos los tipos de cáncer por lo que uno de los objetivos de la investigación en este campo es identificar biomarcadores para ayudar a los oncólogos a decidir qué tratamiento es el más indicado para cada paciente” explica la Dra. Elena Garralda, oncóloga médica del Hospital Universitario Vall d’Hebron y directora de la UITM-CaixaResearch y coautora del estudio.
“En este contexto, las firmas de expresión génica inmunitaria están emergiendo como posibles biomarcadores de respuesta para los tratamientos de inmunoterapia” afirma la Dra. Ana Vivancos, jefa del Grupo de Genómica del Cáncer del VHIO y co-autora de este estudio. “En VHIO hemos desarrollado la herramienta VIGex.
Se trata de un biomarcador basado en los niveles de expresión génica de 12 genes implicados en la respuesta inmune que ha sido validado en las plataformas Nanostring y RNA-Seq en el Laboratorio de Genómica del Cáncer del VHIO y en el Princess Margaret Cancer Centre de Toronto. VIGex clasifica las muestras tumorales en subgrupos calientes, intermedio-frío (I-Cold) y fríos según los niveles de expresión de los genes de respuesta inmune. Se ha asociado VIGex-Caliente (Hot) con mejores resultados en el tratamiento con inmunoterapia.

Combinar VIGex con biopsia líquida

En este estudio, que se ha publicado en la revista JCO Precision Oncology, mediante una colaboración internacional, los equipos de investigación del Princess Margaret Cancer Centre de Toronto y del VHIO analizan el rendimiento de VIGex y otros biomarcadores de respuesta a inmunoterapia en un grupo de pacientes con tumores sólidos avanzados tratados con el fármaco de inmunoterapia pembrolizumab en el ensayo clínico de fase 2 INSPIRE desarrollado en el Princess Margaret Cancer Centre de Toronto. La categorización VIGex-Caliente se asoció con una mayor supervivencia global y una mayor supervivencia libre de progresión.

“Hemos combinado los valores de VIGex con otros biomarcadores como la carga mutacional del tumor, la expresión por inmunohistoquímica de la proteína PD-L1 o el nivel de ADN tumoral circulante en plasma (ctDNA) mediante biopsia líquida. Y observamos que si tenemos en cuenta la categorización VIGex en las muestras tumorales previo al tratamiento y los cambios dinámicos del ctDNA en biopsia líquida se mejora la predicción de respuesta a inmunoterapia” afirma el Dr. Alberto Hernando-Calvo, oncólogo médico del Hospital Universitario Vall d’Hebron, investigador de la UITM-CaixaResearch y el Grupo de Genómica del Cáncer del VHIO y primer autor del artículo.
“Es decir, si un paciente presenta un valor de VIGex caliente en la muestra tumoral previa al inicio de inmunoterapia y disminuye el ctDNA en plasma durante los dos primeros ciclos de inmunoterapia respecto a su nivel basal, esto se asocia con un mayor beneficio clínico para el paciente”.

Próximos pasos para validar estos biomarcadores

“Estos resultados son retrospectivos. Hemos analizado los biomarcadores una vez finalizado el ensayo clínico. Nuestro objetivo en el futuro es ser capaces de analizar estos biomarcadores VIGex y el ctDNA en el curso de un ensayo clínico prospectivo de manera que podamos predecir si el paciente va a responder o no a la inmunoterapia y tomar las decisiones clínicas más beneficiosas para cada paciente, minimizando el riesgo de toxicidades y los costes para el sistema sanitario” afirma el Dr. Alberto Hernando-Calvo.

En ese sentido, con el patrocinio de la Organización Europea para la Investigación y el Tratamiento del Cáncer (EORTC) y la Asociación Española Contra el Cáncer (AECC), un ensayo clínico fase III liderado por la Dra. Irene Braña evaluará la eficacia de un tratamiento combinado de inmunoterapia y radioterapia en pacientes con carcinoma escamoso de cabeza y cuello. En este ensayo se analizarán estos dos biomarcadores: VIGex y los cambios de ctDNA a través de biopsia líquida para estudiar a tiempo real si pueden predecir la respuesta a inmunoterapia.
Por otro lado, el Dr. Alberto Hernando-Clavo ha recibido recientemente una Beca Gilead a la investigación biomédica por un proyecto que tiene como objetivo validar la herramienta VIGex como biomarcador de respuesta en el contexto de ensayos clínicos fases 1 de inmuno-oncología.

Referencias

1- Alberto Hernando-Calvo, S Y Cindy Yang, Maria Vila-Casadesús, Ming Han, Zhihui Amy Liu, A Hal K Berman, Anna Spreafico, Albiruni Abdul Razak, Stephanie Lheureux, Aaron R Hansen, Deborah Lo Giacco, Farnoosh Abbas-Aghababazadeh , Judith Matito , Benjamin Haibe-Kains, Trevor J Pugh, Scott V Bratman, Alexey Aleshin, Roger Berche, Omar Saavedra, Elena Garralda, Sawako Elston, Lillian L Siu, Pamela S Ohashi, Ana Vivancos, Philippe L Bedard. Combined Transcriptome and Circulating Tumor DNA Longitudinal Biomarker Analysis Associates With Clinical Outcomes in Advanced Solid Tumors Treated With Pembrolizumab. JCO Precis Oncol. 2024 Aug:8:e2400100. doi: 10.1200/PO.24.00100.

2- Alberto Hernando-Calvo, Maria Vila-Casadesús, Yacine Bareche, Alberto Gonzalez-Medina, Farnoosh Abbas-Aghababazadeh, Deborah Lo Giacco, Agatha Martin, Omar Saavedra, Irene Brana, Maria Vieito, Roberta Fasani, John Stagg, Francesco Mancuso, Benjamin Haibe-Kains, Ming Han, Roger Berche, Trevor J Pugh, Oriol Mirallas, Jose Jimenez, Nadia Saoudi Gonzalez, Claudia Valverde, Eva Muñoz-Couselo, Cristina Suarez, Marc Diez, Elena Élez, Jaume Capdevila, Ana Oaknin, Cristina Saura, Teresa Macarulla, Joan Carles Galceran, Enriqueta Felip, Rodrigo Dienstmann, Philippe L Bedard, Paolo Nuciforo, Joan Seoane, Josep Tabernero, Elena Garralda, Ana Vivancos. A pan-cancer clinical platform to predict immunotherapy outcomes and prioritize immuno-oncology combinations in early-phase trials. Med. 2023 Oct 13;4(10):710-727.e5. doi: 10.1016/j.medj.2023.07.006. Epub 2023 Aug 11.

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