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Unidad de Bioinformática

Portfolio Item Unidad de Bioinformática
Bioinformatics Unit - VHIO

La Unidad de Bioinformática del VHIO (VHIOinformatics) proporciona a los grupos de investigación recursos computacionales de vanguardia para el análisis de datos ómicos relacionados con el cáncer. Damos apoyo a los investigadores del VHIO mediante la implementación de pipelines bioinformáticos de última generación y el procesamiento de conjuntos de datos multiómicos.

En colaboración con investigadores de múltiples proyectos, participamos en las distintas etapas de la investigación, desde la concepción o el diseño experimental hasta el análisis bioinformático de los datos y la publicación final, con especial atención a la visualización y la interpretación funcional. En 2025 llevamos a cabo 58 análisis de datos en colaboración con 25 grupos de investigación del VHIO. El conjunto de estudios incluyó principalmente datos transcriptómicos y genómicos, además de proyectos de metagenómica shotgun para explorar el microambiente tumoral. También reevaluamos varios conjuntos de datos disponibles públicamente para obtener nuevos conocimientos sobre el desarrollo y la diseminación del cáncer. Tras la reciente incorporación de tecnologías y experiencia en análisis de célula única, actualmente estamos analizando diversos experimentos transcriptómicos y multiómicos de célula única.

Siguiendo los principios rectores FAIR para la gestión de datos científicos, hemos desarrollado una guía para la carga de datos en repositorios públicos, con especial énfasis en el EGA, nuestro repositorio de referencia para datos humanos de acceso controlado. Varios de nuestros conjuntos de datos internos, ya incluidos en publicaciones recientes, se han depositado en repositorios de acceso público para favorecer la ciencia abierta y la reutilización de datos.

Nuestros procedimientos computacionales se basan en software de código abierto desarrollado en un entorno seguro y reproducible. En colaboración con nuestro Departamento de Tecnologías de la Información, hemos continuado ampliando nuestra infraestructura de clúster, disponible para el equipo interno de bioinformática, con la incorporación de una partición de GPU para análisis de inteligencia artificial (IA). Gracias a la acreditación de Excelencia Severo Ochoa que el VHIO recibió en 2021 como Centro de Excelencia Severo Ochoa para el periodo 2022-2026, y al apoyo de CRIS contra el cáncer – Fundación CRIS contra el Cáncer, seguiremos desarrollando esta infraestructura en 2026.

La Unidad de Bioinformática del VHIO forma parte de TransBioNet, la red española de bioinformática traslacional, coordinada por el Instituto Nacional de Bioinformática (INB), que trabaja en asociación con la Infraestructura Europea de Ciencias de la Vida para la Información Biológica (ELIXIR). Asimismo, representamos al VHIO en diversos consorcios y grupos de trabajo.

Lara Nonell 2025 VHIO
Lara Nonell
Group Leader
Biosketch

Líneas de investigación

Con el objetivo de apoyar a los investigadores del VHIO en el desarrollo de sus investigaciones, hemos definido las siguientes líneas de investigación:

  • Ampliar y mantener una infraestructura computacional escalable, incluidos entornos con GPU, para dar soporte a análisis ómicos avanzados y basados en inteligencia artificial.
  • Implementar y optimizar pipelines bioinformáticos de última generación para el procesamiento, la integración, la visualización y la interpretación de datos multiómicos, incluida la reutilización de conjuntos de datos públicos.
  • Desarrollar modelos computacionales integradores y enfoques de aprendizaje automático para apoyar el descubrimiento de biomarcadores y la oncología de precisión.
  • Reforzar la colaboración institucional mediante la promoción de métodos computacionales avanzados en los distintos programas de investigación del VHIO.
  • Consolidar y formar un equipo de bioinformática altamente cualificado, al tiempo que se coordina una red interna para compartir conocimiento, como el Journal Club, con el objetivo de optimizar la experiencia y los recursos.
  • Avanzar en la implantación de prácticas armonizadas de gestión de datos, conformes con los principios FAIR, en los flujos de trabajo ómicos del VHIO.

Equipo

Jefa de grupo

Lara Nonell

Bioinformáticos

Pau Marc Muñoz Torres​

Angel García de la Torre

Irene Agustí Barea

Alba Mas Malavila

Publicaciones

Publicacions més rellevants

  • Giuntini F, González-Larreategui Í, Herencia-Ropero A, Casacuberta-Serra S, Zacarías-Fluck MF, Arnal M, Pedretti F, Martínez-Martín S, Thabussot H, Cano VC, Grueso J, Foradada L, Serrano E, López-Estévez S, Rodriguez O, Guzman M, Rodriguez-Hernandez A, Brasó-Maristany F, Llop-Guevara A, Balmaña J, Nonell L, Prat A, Serra V, Beaulieu ME, Whitfield JR, Massó-Vallés D, Soucek L. MYC inhibition by Omomyc causes DNA damage and overcomes PARPi resistance in breast cancer. Cell Rep. 2025 Dec 23;44(12):116604.
  • Lloret-Llinares M, Carvajal-López P, Downing T, Gogol M, Ho Sui S, Nonell L, Paladin L, Reid AJ, Pomann GM, Brooksbank C. Competencies for bioinformatics core facility scientists: extension of the ISCB competency framework for bioinformatics. Bioinform Adv. 2025 Sep 16;5(1):vbaf206.
  • Martínez-Quintanilla J, Cabot D, Sabia D, Arqués O; PMPnet Group; Vergés J, Chicote I, Bijelic L; PMPnet Group; Cabellos L, Alcántara AM, Ramos I, Barrios P, Crusellas O, Palacio LM; PMPnet Group; Cámara JA, Barriuso J; PMPnet Group; Jiménez JJ, Muñoz-Torres P, Nonell L, Flores R, Médico E, Guaglio M; PMPnet Group; Ros J, Élez E, Tabernero J, Aziz O, Deraco M, Palmer HG; PMPnet Group; PMPnet Group. Precision Oncology and Systemic Targeted Therapy in Pseudomyxoma Peritonei. Clin Cancer Res. 2024 Sep 13;30(18):4082-4099.
  • Casanova-Salas I, Aguilar D, Cordoba-Terreros S, Agundez L, Brandariz J, Herranz N, Mas A, Gonzalez M, Morales-Barrera R, Sierra A, Soriano-Navarro M, Cresta P, Mir G, Simonetti S, Rodrigues G, Arce-Gallego S, Delgado-Serrano L, Agustí I, Castellano-Sanz E, Mast R, de Albert M, Celma A, Santamaria A, Gonzalez L, Castro N, Suanes MDM, Hernández-Losa J, Nonell L, Peinado H, Carles J, Mateo J. Circulating tumor extracellular vesicles to monitor metastatic prostate cancer genomics and transcriptomic evolution. Cancer Cell. 2024 Jul 8;42(7):1301-1312.e7.
  • Pujals M, Mayans C, Bellio C, Méndez O, Greco E, Fasani R, Alemany-Chavarria M, Zamora E, Padilla L, Mitjans F, Nuciforo P, Canals F, Nonell L, Abad M, Saura C, Tabernero J, Villanueva J. RAGE/SNAIL1 signaling drives epithelial-mesenchymal plasticity in metastatic triple-negative breast cancer. Oncogene. 2023 Aug;42(35):2610-2628.
  • Zacarías-Fluck MF, Massó-Vallés D, Giuntini F, González-Larreategui Í, Kaur J, Casacuberta-Serra S, Jauset T, Martínez-Martín S, Martín-Fernández G, Serrano Del Pozo E, Foradada L, Grueso J, Nonell L, Beaulieu ME, Whitfield JR, Soucek L. Reducing MYC’s transcriptional footprint unveils a good prognostic gene signature in melanoma. Genes Dev. 2023 Apr 1;37(7-8):303-320.
  • Martínez-Sabadell A, Morancho B, Rius Ruiz I, Román Alonso M, Ovejero Romero P, Escorihuela M, Chicote I, Palmer HG, Nonell L, Alemany-Chavarria M, Klein C, Bacac M, Arribas J, Arenas EJ. The target antigen determines the mechanism of acquired resistance to T cell-based therapies. Cell Rep. 2022 Oct 18;41(3):111430. 

Totes les publicacions

  • Giuntini F, González-Larreategui Í, Herencia-Ropero A, Casacuberta-Serra S, Zacarías-Fluck MF, Arnal M, Pedretti F, Martínez-Martín S, Thabussot H, Cano VC, Grueso J, Foradada L, Serrano E, López-Estévez S, Rodriguez O, Guzman M, Rodriguez-Hernandez A, Brasó-Maristany F, Llop-Guevara A, Balmaña J, Nonell L, Prat A, Serra V, Beaulieu ME, Whitfield JR, Massó-Vallés D, Soucek L. MYC inhibition by Omomyc causes DNA damage and overcomes PARPi resistance in breast cancer. Cell Rep. 2025 Dec 23;44(12):116604.
  • Lloret-Llinares M, Carvajal-López P, Downing T, Gogol M, Ho Sui S, Nonell L, Paladin L, Reid AJ, Pomann GM, Brooksbank C. Competencies for bioinformatics core facility scientists: extension of the ISCB competency framework for bioinformatics. Bioinform Adv. 2025 Sep 16;5(1):vbaf206.
  • Hernández-Muñoz I, Cuervas I, Prada E, Pulecio J, Gimeno R, Andrades E, Gómez-González S, Berenguer-Molins P, Acedo-Terrades A, Perera-Bel J, Bódalo-Torruella M, Nonell L, Pérez E, Grases D, Mata C, Yélamos J, Richaud-Patin Y, Vidal E, Cuartero Y, Le Dily F, Suñol M, Manzanares A, Raya A, Mora J. EWS::FLI1 expression in human embryonic mesenchymal stem cells leads to transcriptional reprograming, defective DNA damage repair and Ewing sarcoma. Nat Commun. 2025 Oct 24;16(1):9427.
  • Pedretti F, Abdalfttah M, Pellegrino B, Mateo F, Martínez-Sanz P, Herencia-Ropero A, Òdena A, Clavell-Revelles P, Casali G, Domènech H, Monserrat L, Papić D, Mas Malavila A, Pascual-Reguant A, Eixarch H, Guzmán M, Rodríguez O, Grueso J, Simonetti S, Fasani R, Nuciforo P, Espejo C, Florian S, Pujana MÁ, Nonell L, Seoane J, Valge-Archer V, O’Connor MJ, Nieto JC, Heyn H, Balmaña J, Llop-Guevara A, Serra V. Harnessing STING Signaling and Natural Killer Cells Overcomes PARP Inhibitor Resistance in Homologous Recombination-Deficient Breast Cancer. Cancer Res. 2025 May 15;85(10):1888-1908.5: Acedo-Terrades A, Perera-Bel J, Nonell L. The importance of data transformation in RNA-Seq preprocessing for bladder cancer subtyping. BMC Res Notes. 2025 Feb 10;18(1):61.
  • Arce-Gallego S, Cresta Morgado P, Delgado-Serrano L, Simonetti S, Gonzalez M, Romero-Lozano P, Marmolejo D, Morales-Barrera R, Arnau GM, Semidey ME, Aguilar D, Cordoba-Terreros S, Mast R, de Albert M, Planas J, Cuadras M, Maldonado X, Suarez C, Casanova-Salas I, Figols M, Cros S, Mas A, Nonell L, Dienstmann R, Nuciforo P, Vivancos A, Llop-Guevara A, Carles J, Serra V, Mateo J. Homologous recombination repair status in metastatic prostate cancer by next-generation sequencing and functional immunofluorescence. Cell Rep Med. 2025 Feb 18;6(2):101937. a
  • Martínez-Quintanilla J, Cabot D, Sabia D, Arqués O; PMPnet Group; Vergés J, Chicote I, Bijelic L; PMPnet Group; Cabellos L, Alcántara AM, Ramos I, Barrios P, Crusellas O, Palacio LM; PMPnet Group; Cámara JA, Barriuso J; PMPnet Group; Jiménez JJ, Muñoz-Torres P, Nonell L, Flores R, Médico E, Guaglio M; PMPnet Group; Ros J, Élez E, Tabernero J, Aziz O, Deraco M, Palmer HG; PMPnet Group; PMPnet Group. Precision Oncology and Systemic Targeted Therapy in Pseudomyxoma Peritonei. Clin Cancer Res. 2024 Sep 13;30(18):4082-4099.
  • Casanova-Salas I, Aguilar D, Cordoba-Terreros S, Agundez L, Brandariz J, Herranz N, Mas A, Gonzalez M, Morales-Barrera R, Sierra A, Soriano-Navarro M, Cresta P, Mir G, Simonetti S, Rodrigues G, Arce-Gallego S, Delgado-Serrano L, Agustí I, Castellano-Sanz E, Mast R, de Albert M, Celma A, Santamaria A, Gonzalez L, Castro N, Suanes MDM, Hernández-Losa J, Nonell L, Peinado H, Carles J, Mateo J. Circulating tumor extracellular vesicles to monitor metastatic prostate cancer genomics and transcriptomic evolution. Cancer Cell. 2024 Jul 8;42(7):1301-1312.e7.
  • Pujals M, Mayans C, Bellio C, Méndez O, Greco E, Fasani R, Alemany-Chavarria M, Zamora E, Padilla L, Mitjans F, Nuciforo P, Canals F, Nonell L, Abad M, Saura C, Tabernero J, Villanueva J. RAGE/SNAIL1 signaling drives epithelial-mesenchymal plasticity in metastatic triple-negative breast cancer. Oncogene. 2023 Aug;42(35):2610-2628.
  • Zacarías-Fluck MF, Massó-Vallés D, Giuntini F, González-Larreategui Í, Kaur J, Casacuberta-Serra S, Jauset T, Martínez-Martín S, Martín-Fernández G, Serrano Del Pozo E, Foradada L, Grueso J, Nonell L, Beaulieu ME, Whitfield JR, Soucek L. Reducing MYC’s transcriptional footprint unveils a good prognostic gene signature in melanoma. Genes Dev. 2023 Apr 1;37(7-8):303-320.
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  • Hernández-Llodrà S, Segalés L, Juanpere N, Marta Lorenzo T, Salido M, Nonell L, David López T, Rodríguez-Vida A, Bellmunt J, Fumadó L, Cecchini L, Lloreta- Trull J. SPOP and CHD1 alterations in prostate cancer: Relationship with PTEN loss, tumor grade, perineural infiltration, and PSA recurrence. Prostate. 2021 Sep 17. doi: 10.1002/pros.24218. Epub ahead of print. PMID: 34533858.
  • Palou-Márquez G, Subirana I, Nonell L, Fernández-Sanlés A, Elosua R. DNA methylation and gene expression integration in cardiovascular disease. Clin Epigenetics. 2021 Apr 9;13(1):75. doi: 10.1186/s13148-021-01064-y. PMID: 33836805; PMCID: PMC8034168.
  • Martín-Sánchez A, Piñero J, Nonell L, Arnal M, Ribe EM, Nevado-Holgado A, Lovestone S, Sanz F, Furlong LI, Valverde O. Comorbidity between Alzheimer’s disease and major depression: a behavioural and transcriptomic characterization study in mice. Alzheimers Res Ther. 2021 Apr 2;13(1):73. doi: 10.1186/s13195-021-00810-x. PMID: 33795014; PMCID: PMC8017643.
  • Puiggros A, Blanco G, Muntasell A, Rodríguez-Rivera M, Nonell L, Altadill M, Puigdecanet E, Arnal M, Calvo X, Gimeno E, Abella E, Abrisqueta P, Bosch F, Yélamos J, Ferrer A, López-Botet M, Espinet B. Reduced expansion of CD94/NKG2C<sup>+</sup> NK cells in chronic lymphocytic leukemia and CLL-like monoclonal B-cell lymphocytosis is not related to increased human cytomegalovirus seronegativity or NKG2C deletions. Int J Lab Hematol. 2021 Oct;43(5):1032-1040. doi: 10.1111/ijlh.13494. Epub 2021 Feb 22. PMID: 33615729.
  • Gil-Gómez G, Fassan M, Nonell L, Garrido M, Climent M, Anglada R, Iglesias M, Guzzardo V, Borga C, Grande L, de Bolós C, Pera M. miR-24-3p regulates CDX2 during intestinalization of cardiac-type epithelium in a human model of Barrett’s esophagus. Dis Esophagus. 2021 Jul 12;34(7):doab005. doi: 10.1093/dote/doab005. PMID: 33558874.
  • Blanco G, Puiggros A, Sherry B, Nonell L, Calvo X, Puigdecanet E, Chiu PY, Kieso Y, Ferrer G, Palacios F, Arnal M, Rodríguez-Rivera M, Gimeno E, Abella E, Rai KR, Abrisqueta P, Bosch F, Calon A, Ferrer A, Chiorazzi N, Espinet B. Chronic lymphocytic leukemia-like monoclonal B-cell lymphocytosis exhibits an increased inflammatory signature that is reduced in early-stage chronic lymphocytic leukemia. Exp Hematol. 2021 Mar;95:68-80. doi: 10.1016/j.exphem.2020.12.007. Epub 2021 Jan 7. PMID: 33421548.
  • Almanza-Aguilera E, Hernáez Á, Corella D, Sanllorente A, Ros E, Portolés O, Valussi J, Estruch R, Coltell O, Subirana I, Canudas S, Razquin C, Blanchart G, Nonell L, Fitó M, Castañer O. Cancer Signaling Transcriptome Is Upregulated in Type 2 Diabetes Mellitus. J Clin Med. 2020 Dec 29;10(1):85. doi: 10.3390/jcm10010085. PMID: 33383630; PMCID: PMC7795776.
  • García-Colmenero L, González J, Sandoval J, Guillén Y, Diaz-Lagares A, Andrades E, Iglesias A, Nonell L, Pujol RM, Bigas A, Espinosa L, Gallardo F. Epigenetic Silencing of Tumor Suppressor miR-124 Directly Supports STAT3 Activation in Cutaneous T-Cell Lymphoma. Cells. 2020 Dec 15;9(12):2692. doi: 10.3390/cells9122692. PMID: 33333886; PMCID: PMC7765332.
  • Segura S, Gadea A, Nonell L, Andrades E, Sánchez S, Pujol R, Hernández-Muñoz I, Toll A. Identification of differentially expressed genes in actinic keratosis samples treated with ingenol mebutate gel. PLoS One. 2020 May 15;15(5):e0232146. doi: 10.1371/journal.pone.0232146. PMID: 32413042; PMCID: PMC7228095.
  • Dégano IR, Camps-Vilaró A, Subirana I, García-Mateo N, Cidad P, Muñoz-Aguayo D, Puigdecanet E, Nonell L, Vila J, Crepaldi FM, de Gonzalo-Calvo D, Llorente-Cortés V, Pérez-García MT, Elosua R, Fitó M, Marrugat J. Association of Circulating microRNAs with Coronary Artery Disease and Usefulness for Reclassification of Healthy Individuals: The REGICOR Study. J Clin Med. 2020 May 9;9(5):1402. doi: 10.3390/jcm9051402. PMID: 32397522; PMCID: PMC7290581.
  • Almanza-Aguilera E, Hernáez A, Corella D, Aguayo DM, Ros E, Portolés O, Valussi J, Estruch R, Coltell O, Subirana I, Salas-Salvadó J, Ruiz-Canela M, de la Torre R, Nonell L, Fitó M, Castañer O. Transcriptional response to a Mediterranean diet intervention exerts a modulatory effect on neuroinflammation signaling pathway. Nutr Neurosci. 2020 Apr 15:1-10. doi: 10.1080/1028415X.2020.1749334. Epub ahead of print. PMID: 32290787.
  • Carrillo-Reixach J, Torrens L, Simon-Coma M, Royo L, Domingo-Sàbat M, Abril-Fornaguera J, Akers N, Sala M, Ragull S, Arnal M, Villalmanzo N, Cairo S, Villanueva A, Kappler R, Garrido M, Guerra L, Sábado C, Guillén G, Mallo M, Piñeyro D, Vázquez-Vitali M, Kuchuk O, Mateos ME, Ramírez G, Santamaría ML, Mozo Y, Soriano A, Grotzer M, Branchereau S, de Andoin NG, López-Ibor B, López-Almaraz R, Salinas JA, Torres B, Hernández F, Uriz JJ, Fabre M, Blanco J, Paris C, Bajčiová V, Laureys G, Masnou H, Clos A, Belendez C, Guettier C, Sumoy L, Planas R, Jordà M, Nonell L, Czauderna P, Morland B, Sia D, Losic B, Buendia MA, Sarrias MR, Llovet JM, Armengol C. Epigenetic footprint enables molecular risk stratification of hepatoblastoma with clinical implications. J Hepatol. 2020 Aug;73(2):328-341. doi: 10.1016/j.jhep.2020.03.025. Epub 2020 Mar 30. PMID: 32240714.
  • Bustamante M, Hernandez-Ferrer C, Tewari A, Sarria Y, Harrison GI, Puigdecanet E, Nonell L, Kang W, Friedländer MR, Estivill X, González JR, Nieuwenhuijsen M, Young AR. Dose and time effects of solar-simulated ultraviolet radiation on the in vivo human skin transcriptome. Br J Dermatol. 2020 Jun;182(6):1458-1468. doi: 10.1111/bjd.18527. Epub 2019 Nov 27. PMID: 31529490; PMCID: PMC7318624.
  • Hardy-Werbin M, Rocha P, Arpi O, Taus Á, Nonell L, Durán X, Villanueva X, Joseph-Pietras D, Nolan L, Danson S, Griffiths R, Lopez-Botet M, Rovira A, Albanell J, Ottensmeier C, Arriola E. Serum cytokine levels as predictive biomarkers of benefit from ipilimumab in small cell lung cancer. Oncoimmunology. 2019 Mar 27;8(6):e1593810. doi: 10.1080/2162402X.2019.1593810. PMID: 31069160; PMCID: PMC6492977.
  • de la Oliva J, Larque AB, Marti C, Bodalo-Torruella M, Nonell L, Nadal A, Castillo P, Sieira R, Ferrer A, Garcia-Diez E, Alos L. Oral premalignant lesions of smokers and non-smokers show similar carcinogenic pathways and outcomes. A clinicopathological and molecular comparative analysis. J Oral Pathol Med. 2021 Mar;50(3):280-286. doi: 10.1111/jop.12864. Epub 2019 Jul 9. PMID: 31006144.
  • García-Díez I, Hernández-Muñoz I, Hernández-Ruiz E, Nonell L, Puigdecanet E, Bódalo-Torruella M, Andrades E, Pujol RM, Toll A. Transcriptome and cytogenetic profiling analysis of matched in situ/invasive cutaneous squamous cell carcinomas from immunocompetent patients. Genes Chromosomes Cancer. 2019 Mar;58(3):164-174. doi: 10.1002/gcc.22712. Epub 2019 Jan 7. PMID: 30474248.
  • Pascual-Reguant L, Blanco E, Galan S, Le Dily F, Cuartero Y, Serra-Bardenys G, Di Carlo V, Iturbide A, Cebrià-Costa JP, Nonell L, de Herreros AG, Di Croce L, Marti-Renom MA, Peiró S. Lamin B1 mapping reveals the existence of dynamic and functional euchromatin lamin B1 domains. Nat Commun. 2018 Aug 24;9(1):3420. doi: 10.1038/s41467-018-05912-z. PMID: 30143639; PMCID: PMC6109041.
  • De-Ugarte L, Serra-Vinardell J, Nonell L, Balcells S, Arnal M, Nogues X, Mellibovsky L, Grinberg D, Diez-Perez A, Garcia-Giralt N. Expression profiling of microRNAs in human bone tissue from postmenopausal women. Hum Cell. 2018 Jan;31(1):33-41. doi: 10.1007/s13577-017-0181-y. Epub 2017 Sep 20. PMID: 28933035.
  • Bustamante M, Hernandez-Ferrer C, Sarria Y, Harrison GI, Nonell L, Kang W, Friedländer MR, Estivill X, González JR, Nieuwenhuijsen M, Young AR. The acute effects of ultraviolet radiation on the blood transcriptome are independent of plasma 25OHD<sub>3</sub>. Environ Res. 2017 Nov;159:239-248. doi: 10.1016/j.envres.2017.07.045. Epub 2017 Sep 18. PMID: 28822308.
  • Garcia-Elias A, Alloza L, Puigdecanet E, Nonell L, Tajes M, Curado J, Enjuanes C, Díaz O, Bruguera J, Martí-Almor J, Comín-Colet J, Benito B. Defining quantification methods and optimizing protocols for microarray hybridization of circulating microRNAs. Sci Rep. 2017 Aug 10;7(1):7725. doi: 10.1038/s41598-017-08134-3. PMID: 28798363; PMCID: PMC5552704.
  • Companioni O, Sanz-Anquela JM, Pardo ML, Puigdecanet E, Nonell L, García N, Parra Blanco V, López C, Andreu V, Cuatrecasas M, Garmendia M, Gisbert JP, Gonzalez CA, Sala N. Gene expression study and pathway analysis of histological subtypes of intestinal metaplasia that progress to gastric cancer. PLoS One. 2017 Apr 25;12(4):e0176043. doi: 10.1371/journal.pone.0176043. PMID: 28441455; PMCID: PMC5404762.
  • Giménez-Arnau A, Curto-Barredo L, Nonell L, Puigdecanet E, Yelamos J, Gimeno R, Rüberg S, Santamaria-Babi L, Pujol RM. Transcriptome analysis of severely active chronic spontaneous urticaria shows an overall immunological skin involvement. Allergy. 2017 Nov;72(11):1778-1790. doi: 10.1111/all.13183. Epub 2017 May 26. PMID: 28407332.
  • Colomo L, Vazquez I, Papaleo N, Espinet B, Ferrer A, Franco C, Comerma L, Hernandez S, Calvo X, Salar A, Climent F, Mate JL, Forcada P, Mozos A, Nonell L, Martinez A, Carrio A, Costa D, Dlouhy I, Salaverria I, Martin-Subero JI, Lopez-Guillermo A, Valera A, Campo E; Grup per l’Estudi dels Limfomes de Catalunya i Balears (GELCAB). LMO2-negative Expression Predicts the Presence of MYC Translocations in Aggressive B-Cell Lymphomas. Am J Surg Pathol. 2017 Jul;41(7):877-886. doi: 10.1097/PAS.0000000000000839. Erratum in: Am J Surg Pathol. 2019 Mar;43(3):434. PMID: 28288039.
  • Alonso S, Mayol X, Nonell L, Salvans S, Pascual M, Pera M; Colorectal Cancer Research Group (Hospital del Mar Medical Research Institute). Peripheral blood leucocytes show differential expression of tumour progression-related genes in colorectal cancer patients who have a postoperative intra-abdominal infection: a prospective matched cohort study. Colorectal Dis. 2017 May;19(5):O115-O125. doi: 10.1111/codi.13635. PMID: 28214365.
  • Lloreta J, Font-Tello A, Juanpere N, Frances A, Lorenzo M, Nonell L, de Muga S, Vázquez I, Cecchini L, Hernández-Llodrà S. FOXO1 down-regulation is associated with worse outcome in bladder cancer and adds significant prognostic information to p53 overexpression. Hum Pathol. 2017 Apr;62:222-231. doi: 10.1016/j.humpath.2016.12.022. Epub 2017 Jan 11. PMID: 28087474.
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