Programa de preselección molecular

El Programa de preselección molecular del VHIO, impulsado por el programa institucional de Diagnóstico Molecular Avanzado (DIAMAV) de la Fundación FERO, cataliza la medicina de precisión en el VHIO. A lo largo de la última década, este programa ha proporcionado acceso a diagnósticos moleculares avanzados a más de 9000 pacientes oncológicos y es fundamental a la hora de emparejar abordajes terapéuticos dirigidos con cientos de oportunidades de ensayos clínicos.

Este programa, que también cuenta con el apoyo y la experiencia de nuestra Unidad de Investigación de Terapia Molecular del Cáncer (UITM) – CaixaResearch, está codirigido por Ana Vivancos, Paolo Nuciforo, Elena Garralda (también directora de la UITM) y Rodrigo Dientsmann, investigadores principales de nuestros grupos de Genómica del Cáncer, Oncología Molecular, Desarrollo Clínico Precoz de Fármacos y Oncology Data Science – OdysSey, respectivamente. Las actividades están coordinadas por Susana Aguilar, jefa de la Unidad VHIOTECA, en colaboración con Jenifer González, técnico de apoyo a la investigación (Grupo de Genómica del Cáncer del VHIO).

El objetivo principal de la preselección molecular es facilitar la aplicación clínica de los nuevos biomarcadores oncológicos, que ayudan a optimizar la selección de tratamientos para los pacientes cuya participación en ensayos clínicos se esté valorando. Nuestro programa orienta a los médicos en la selección de nuevos tratamientos de referencia y experimentales contra el cáncer y facilita la investigación correlativa clinicomolecular en el VHIO. Se desarrollan y validan internamente pruebas diagnósticas para la identificación rentable y racionalizada de alteraciones moleculares tumorales de gran interés para el desarrollo de fármacos.

La elaboración de perfiles tumorales incluye una variedad de técnicas genómicas, como los paneles de secuenciación de última generación (NGS) para la detección de mutaciones, las variaciones en el número de copias, las fusiones de genes y firmas de expresión de ARN, así como técnicas histopatológicas como la inmunohistoquímica (IHQ) y la hibridación in situ (ISH) para la elaboración de perfiles de expresión de proteínas y genes.

En 2022, elaboramos perfiles moleculares tumorales de más de 1137 tumores de pacientes con cáncer. Estos pacientes son candidatos a participar en ensayos clínicos. Cabe destacar la implantación de una prueba NGS para detectar alteraciones genómicas en la biopsia líquida. Esta nueva prueba se ha aplicado a más de 100 pacientes que podrían haber adquirido resistencia a tratamientos dirigidos o que carecían de biopsias de tejido metastásico para hacer la prueba. En total, gracias a este trabajo se trató a 160 pacientes con tratamientos innovadores compatibles con biomarcadores.

La interpretación de las pruebas de secuenciación de última generación y la formación de los médicos en biomarcadores emergentes es otra de nuestras áreas prioritarias. Durante las reuniones de la Junta de Tumores Moleculares y la Junta de Tumores Genéticos, facilitamos el intercambio de datos entre una amplia gama de expertos para la revisión de los historiales médicos de los pacientes y los perfiles moleculares del cáncer con el fin de orientar con mayor precisión las decisiones terapéuticas y las medidas preventivas.

VHIO’s Molecular Prescreening Program

Figura: Programa de preselección molecular en el VHIO. (A) Interrelación entre los laboratorios de patología genómica y molecular con los oncólogos clínicos y funcionalidad del programa de preselección. (B) Número de pruebas genómicas y proteómicas por tipo de tumor.

  • Implementación clínica de diagnósticos moleculares avanzados para optimizar la selección de terapias para pacientes que se están considerando para su inscripción en ensayos clínicos.
  • Formación médica continuada con informes estandarizados de alteraciones genómicas y Juntas de Tumores Moleculares semanales.
  • Revisión y actualización continuas de las pruebas de diagnóstico molecular para incluir biomarcadores emergentes para la oncología de precisión.
  • Hernando-Calvo A, Vila-Casadesús M, Bareche Y, Gonzalez-Medina A, Abbas-Aghababazadeh F, Lo Giacco D, Martin A, Saavedra O, Brana I, Vieito M, Fasani R, Stagg J, Mancuso F, Haibe-Kains B, Han M, Berche R, Pugh TJ, Mirallas O, Jimenez J, Gonzalez NS, Valverde C, Muñoz-Couselo E, Suarez C, Diez M, Élez E, Capdevila J, Oaknin A, Saura C, Macarulla T, Galceran JC, Felip E, Dienstmann R, Bedard PL, Nuciforo P, Seoane J, Tabernero J, Garralda E, Vivancos A. A pan-cancer clinical platform to predict immunotherapy outcomes and prioritize immuno-oncology combinations in early-phase trials. Med. 2023 Oct 13;4(10):710-727.e5.
  • Hernando-Calvo A, Mirallas O, Marmolejo D, Saavedra O, Vieito M, Assaf Pastrana JD, Aguilar S, Bescós C, Lorente J, Giralt J, Benavente S, Temprana-Salvador J, Alberola M, Dienstmann R, Garralda E, Felip E, Villacampa G, Brana I. Nutritional status associates with immunotherapy clinical outcomes in recurrent or metastatic head and neck squamous cell carcinoma patients. Oral Oncol. 2023 May;140:106364.
  • Mulet Margalef N, Castillo C, Mosteiro M, Pérez X, Aguilar S, Ruíz-Pace F, Gil M, Cuadra C, Ruffinelli JC, Martínez M, Losa F, Soler G, Teulé À, Castany R, Gallego R, Ruíz A, Garralda E, Élez E, Vivancos A, Tabernero J, Salazar R, Dienstmann R, Santos Vivas C. Genomically matched therapy in refractory colorectal cancer according to ESMO Scale for Clinical Actionability of Molecular Targets: experience of a comprehensive cancer centre network. Mol Oncol. 2023 Sep;17(9):1908-1916.
Co-directores
Ana Vivancos
Paolo Nuciforo
Elena Garralda
Rodrigo Dienstmann
Coordinadora del Programa
Susana Aguilar
Técnica de apoyo a la investigación
Jenifer González

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