El Grupo de Biomarcadores y Dinámica Clonal del VHIO se dedica a explorar las complejidades moleculares y las variables que influyen en los resultados clínicos de los pacientes. Su objetivo es avanzar en la investigación del cáncer mediante la aplicación innovadora de análisis evolutivos de tumores utilizando biopsias líquidas longitudinales de tumores y ADN tumoral circulante (ctADN) en diferentes contextos clínicos y terapéuticos, incluidas las inmunoterapias contra el cáncer y las terapias dirigidas. También estudian el impacto de la hipoxia en la tumorigénesis y las características clínicas, la selección de mutaciones EPAS1-HIF2α y la eficacia de los inhibidores de HIF2α.
El Grupo de Biomarcadores y Dinámica Clonal del VHIO aplica análisis innovadores de evolución tumoral en muestras longitudinales de tumor y de biopsia líquida de ADN tumoral circulante (ctDNA) en distintos contextos clínicos y terapéuticos. A través de este enfoque integrador, nuestra investigación busca desentrañar la complejidad evolutiva de los cánceres humanos y aportar información accionable que pueda trasladarse a la práctica clínica, con un enfoque principal en la inmunoterapia del cáncer y las terapias dirigidas.
Nuestra investigación en biopsia líquida también se extiende a malignidades adrenales poco frecuentes, incluidos los feocromocitomas y paragangliomas (PPGL), así como los carcinomas adrenocorticales (ACC), donde aplicamos estrategias basadas en ctDNA para mejorar el seguimiento de la enfermedad y la toma de decisiones terapéuticas.
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Aplicar ensayos multimodales de ctDNA para predecir la respuesta a la inmunoterapia y a las terapias dirigidas en distintos tipos tumorales.
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Caracterizar la heterogeneidad tumoral: examinar la heterogeneidad temporal de los tumores mediante enfoques de secuenciación de tumor y biopsia líquida durante la respuesta al tratamiento y la progresión de la enfermedad, particularmente en el contexto de la inmunoterapia y las terapias dirigidas.
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Investigar los mecanismos de resistencia a fármacos oncológicos en inmunoterapia y terapias dirigidas para identificar posibles biomarcadores de resistencia en biopsia líquida que orienten estrategias terapéuticas más eficaces.
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Evaluar la utilidad clínica del análisis de ADN tumoral circulante (ctDNA) en cánceres adrenales poco frecuentes, como feocromocitomas, paragangliomas (PPGL) y carcinomas adrenocorticales (ACC).
Jefe de Grupo
Rodrigo A. Toledo
PhD Students
Carlota Arenillas
Oriol Mirallas Viñas
Ana Belen Moreno-Cárdenas
Gestora de Datos
Alma Calahorro
Técnico de Laboratorio
Aya Louhamane
Bioinformática
Debayan Datta
Adriana Barea
Alessandra Bonilla
Data Scientist
Kira Raskina
- Wyatt, A. W., Litiere, S., Bidard, F. C., Cabel, L., Dyrskjøt, L., Karlovich, C. A., Pantel, K., Petrie, J., Philip, R., Andrews, H. S., Vellanki, P. J., Tolmeijer, S. H., Villalobos Alberu, X., Alfano, C., Bogaerts, J., Calvo, E., Chen, A. P., Toledo, R. A., de Vries, E. G. E., … RECIST ctDNA workshop group. (2024). Plasma ctDNA as a treatment response biomarker in metastatic cancers: Evaluation by the RECIST working group. Clinical Cancer Research, 30(22), 5034-5041. https://doi.org/10.1158/1078-0432.CCR-24-1883
- Stanley, K. E., Jatsenko, T., Tuveri, S., Sudhakaran, D., Lannoo, L., Van Calsteren, K., de Borre, M., Van Parijs, I., Van Coillie, L., Van Den Bogaert, K., De Almeida Toledo, R., Lenaerts, L., Tejpar, S., Punie, K., Rengifo, L. Y., Vandenberghe, P., Thienpont, B., & Vermeesch, J. R. (2024). Cell type signatures in cell-free DNA fragmentation profiles reveal disease biology. Nature Communications, 15(1), 2220. https://doi.org/10.1038/s41467-024-46435-0
- Prior, O., Macarro, C., Navarro, V., Monreal, C., Ligero, M., Garcia-Ruiz, A., Serna, G., Simonetti, S., Braña, I., Vieito, M., Escobar, M., Capdevila, J., Byrne, A. T., Dienstmann, R., Toledo, R., Nuciforo, P., Garralda, E., Grussu, F., Bernatowicz, K., & Perez-Lopez, R. (2024). Identification of precise 3D CT radiomics for habitat computation by machine learning in cancer. Radiology: Artificial Intelligence, 6(2), e230118. https://doi.org/10.1148/ryai.230118
- Ligero, M., Serna, G., El Nahhas, O. S. M., Sansano, I., Mauchanski, S., Viaplana, C., Calderaro, J., Toledo, R. A., Dienstmann, R., Vanguri, R. S., Sauter, J. L., Sanchez-Vega, F., Shah, S. P., Ramón Y Cajal, S., Garralda, E., Nuciforo, P., Perez-Lopez, R., & Kather, J. N. (2024). Weakly supervised deep learning predicts immunotherapy response in solid tumors based on PD-L1 expression. Cancer Research Communications, 4(1), 92-102. https://doi.org/10.1158/2767-9764.CRC-23-0287
- Huebner A, Black JRM, Sarno F, Pazo R, Juez I, Medina L, Garcia-Carbonero R, Guillén C, Feliú J, Alonso C, Arenillas C, Moreno-Cárdenas AB, Verdaguer H, Macarulla T, Hidalgo M, McGranahan N, Toledo RA. ACT-Discover: identifying karyotype heterogeneity in pancreatic cancer evolution using ctDNA. Genome Med. 2023 Apr 20;15(1):27.
- Targeting Ferroptosis as a new therapeutic approach to overcome resistance to checkpoint inhibitors. Funded by: Agencia de Gestió d’Ajuts Universitaris i de Recerca (AGAUR). Reference: 2024 LLAV 00119. 12/01/2024 – 05/31/2025. PI: Rodrigo Toledo.
- Inicio del análisis de datos del proyecto de inmunoterapia IMMUNOMICs-ctDNA.
- Validación por grupos científicos internacionales de nuestro descubrimiento de mutaciones RNF43 como biomarcadores predictivos de respuesta en pacientes con cáncer colorrectal (CCR) con mutación BRAF tratados con terapia anti-BRAF/EGFR.
- Desarrollo de ACT-Discover para aumentar la sensibilidad de la detección de ctADN en muestras de plasma.
- Se ha revisado la eficacia de los inhibidores del factor inducible por hipoxia-2 alfa (HIF2α) en tumores que albergan mutaciones en la vía de la hipoxia.
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