- El VHIO participa en este proyecto con el objetivo de universalizar la interpretación de genomas de tumores para la medicina personalizada del cáncer
Del 21 al 23 de noviembre de 2022 se celebró la Reunión de lanzamiento de CGI-Clinics, un proyecto a cinco años financiado por la Unión Europea y el UK Research and Innovation, que comenzó el 1 de noviembre.60 participantes de las 17 instituciones miembros del consorcio se dieron cita en Empúries (Girona).
El proyecto tiene como objetivo desarrollar el Cancer Genome Interpreter (CGI) una herramienta bioinformática lo suficientemente potente como para lograr el objetivo de sistematizar la interpretación del genoma tumoral para la toma de decisiones clínicas, permitiendo así a los médicos elegir los tratamientos oncológicos más efectivos para cada paciente.
La herramienta utiliza el aprendizaje automático y otros métodos computacionales para extraer información de forma sistemática de las mutaciones observadas en miles de tumores para mejorar la interpretación de las variantes observadas en cada paciente.
“El Cancer Genome Interpreter (CGI), en el que llevamos trabajando más de cinco años, tiene un potencial enorme y, a través de este proyecto, pretendemos optimizarlo para su uso en hospitales y centros sanitarios. Queremos que sea un instrumento clave en el apoyo a la toma de decisiones de los oncólogos clínicos, para que cada paciente, independientemente del hospital en el que se realice el diagnóstico, reciba el tratamiento más adecuado”, explica la Dra. Nuria López-Bigas investigadora ICREA y jefa del laboratorio de Genómica Biomédica del IRB Barcelona, coordinadora del consorcio.
Los participantes en la reunión de lanzamiento pasaron tres días beneficiándose de excelentes presentaciones y charlas científicas, y compartiendo metodologías y acciones para los próximos cinco años. Hubo varios talleres y sesiones paralelas para comenzar el desarrollo de la nueva herramienta e intercambiar ideas sobre los diferentes aspectos del proyecto
La mejor opción terapéutica independientemente del centro de atención
El proyecto también incluye la creación del comité virtual de tumores moleculares que incluye expertos internacionales con los que los médicos pueden consultar y discutir el informe producido por el CGI.
Esta parte del proyecto está liderada por la Dra. Ana Vivancos, jefa del grupo de Genómica del Cáncer del VHIO, y su objetivo es favorecer el intercambio de conocimientos para ofrecer un manejo terapéutico óptimo a todos los pacientes independientemente de su centro de atención.
“Este comité de tumores estará integrado por los mejores expertos europeos en genómica, así como en oncología, patología, genética o biología molecular. Este equipo se reunirá periódicamente para discutir los casos y así ayudar al oncólogo a tomar decisiones sobre las mejores opciones terapéuticas para su paciente, integrando los resultados de las pruebas genómicas que se hayan realizado dentro el curso clínico. En definitiva, el objetivo es que a pesar de que este nivel de experiencia se encuentra principalmente en centros grandes, los hospitales y centros más pequeños puedan acceder a opiniones de expertos con facilidad”, comenta la Dra. Ana Vivancos.
Un proyecto impulsado por la Comunidad Europea
Incluyendo las asociaciones de pacientes, el IRB Barcelona colaborará en este proyecto con 17 entidades europeas de distinta tipología, que ofrecen experiencias complementarias para abordar la implementación de la medicina personalizada del cáncer, en los sistemas de salud europeos, desde todos los ángulos.
Como centros médicos, están asociados al proyecto nueve hospitales y centros de salud de cuatro países europeos, que serán los primeros en probar la herramienta dentro de su rutina clínica: el Vall d’Hebron Instituto de Oncología (VHIO), el Institut Gustave Roussy de París, el Leon Berard Centre de Lutte Contre le Cancer de Lion, el Uniklinik RWTH AACHEN y el Uniklinik KÖLN de Alemania, el Manchester Research Cancer Centre, el Instituto de Investigaciones Biomédicas de Girona Dr. Josep Trueta, la Red Assistencial Universitaria de Manresa Althaia y el Servicio Andaluz de Salud, así como el Instituto Catalán de Oncología (ICO) y la Fundación Progreso y Salud de la Junta de Andalucía.
Como centros de investigación, además del IRB Barcelona, también es socio del proyecto el Centro Nacional de Análisis Genómico (CNAG – CRG). La empresa Alira Health es el socio encargado de velar por toda la parte regulatoria y la European Association for Cancer Research gestionará las acciones de comunicación asociadas al proyecto.
Un pilar clave de este proyecto es la participación de las personas con cáncer. Los socios del proyecto, la Coalición Europea de Pacientes con Cáncer y la Asociación Española Contra el Cáncer, representarán a la sociedad ya los pacientes.
Participación del paciente
El proyecto tiene como objetivo involucrar a los pacientes con cáncer para que puedan desempeñar un papel activo en el proceso de su propio tratamiento personalizado contra el cáncer. Con este fin, la herramienta final de interpretación del genoma creada por el proyecto también proporcionará a los pacientes un informe que podrán discutir con su médico, informándoles sobre las características moleculares de su tumor y lo que esto significa para su tratamiento.
El proyecto también busca resaltar el valor de la información y concienciar a los pacientes de que pueden ayudar a mejorar el sistema aceptando compartir los detalles moleculares de sus tumores y su información clínica. En su versión actual, los algoritmos del Cancer Genome Interpreter se han desarrollado a partir del análisis de los genomas de los tumores de 28.000 pacientes, que abarcan más de 66 tipos de cáncer, que están a disposición de la comunidad científica en repositorios públicos. A medida que se agreguen nuevos tumores secuenciados en el transcurso del proyecto, los métodos de aprendizaje automático mejorarán sus predicciones, lo que mejorará la interpretación de las mutaciones tumorales para los nuevos pacientes.
Sigue el progreso del proyecto
La reunión de lanzamiento marcó la pauta para este emocionante y ambicioso proyecto, y todos los socios están muy motivados para lograr el objetivo principal de llevar a cabo una iniciativa comunitaria para fomentar la implementación de la medicina oncológica de precisión en los hospitales, en beneficio de los pacientes con cáncer.
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