VHIO participa en aquest projecte amb l’objectiu d’universalitzar la interpretació dels genomes de tumors per a la medicina personalitzada del càncer
Del 21 al 23 de novembre del 2022 es va celebrar la Reunió de llançament de CGI-Clinics, un projecte a cinc anys finançat per la Unió Europea i l’UK Research and Innovation, que va començar l’1 de novembre. 60 participants de les 17 institucions membres del consorci es van donar cita a Empúries (Girona).
El projecte té com a objectiu desenvolupar el Cancer Genome Interpreter (CGI) una eina bioinformàtica prou potent per aconseguir l’objectiu de sistematitzar la interpretació del genoma tumoral per a la presa de decisions clíniques, permetent així als metges triar els tractaments oncològics més efectius per a cada pacient.
L’eina utilitza l’aprenentatge automàtic i altres mètodes computacionals per extreure informació de manera sistemàtica de les mutacions observades en milers de tumors per millorar la interpretació de les variants observades a cada pacient.
“El Cancer Genome Interpreter (CGI), en el qual fa més de cinc anys que treballem, té un potencial enorme i, a través d’aquest projecte, pretenem optimitzar-lo per al seu ús en hospitals i centres sanitaris. Volem que sigui un instrument clau en el suport a la presa de decisions dels oncòlegs clínics, perquè cada pacient, independentment de l’hospital on es faci el diagnòstic, rebi el tractament més adequat”, explica la Dra. Nuria López-Bigas investigadora ICREA i cap del laboratori de Genòmica Biomèdica de l’IRB Barcelona, coordinadora del consorci.
Els participants a la reunió de llançament van passar tres dies beneficiant-se d’excel·lents presentacions i xerrades científiques, i compartint metodologies i accions per als propers cinc anys. Hi va haver diversos tallers i sessions paral·leles per començar el desenvolupament de la nova eina i intercanviar idees sobre els diferents aspectes del projecte
La millor opció terapèutica independentment del centre d’atenció
El projecte també inclou la creació del comitè virtual de tumors moleculars que inclou experts internacionals amb què els metges poden consultar i discutir l’informe produït pel CGI.
Aquesta part del projecte està liderada per la Dra. Ana Vivancos, cap del grup de Genòmica del Càncer del VHIO, i el seu objectiu és afavorir l’intercanvi de coneixements per oferir un maneig terapèutic òptim a tots els pacients independentment del seu centre d’atenció.
“Aquest comitè de tumors estarà integrat pels millors experts europeus en genòmica, així com oncologia, patologia, genètica o biologia molecular. Aquest equip es reunirà periòdicament per discutir els casos i així ajudar l’oncòleg a prendre decisions sobre les millors opcions terapèutiques per al pacient, integrant els resultats de les proves genòmiques que s’hagin realitzat dins el curs clínic. En definitiva, l’objectiu és que tot i que aquest nivell d’experiència es troba principalment a centres grans, els hospitals i centres més petits puguin accedir a opinions d’experts amb facilitat”, comenta la Dra. Ana Vivancos.
Un projecte impulsat per la Comunitat Europea
Incloent-hi les associacions de pacients, l’IRB Barcelona col·laborarà en aquest projecte amb 17 entitats europees de diferent tipologia, que ofereixen experiències complementàries per abordar la implementació de la medicina personalitzada del càncer, en els sistemes de salut europeus, des de tots els angles.
Com a centres mèdics, estan associats al projecte nou hospitals i centres de salut de quatre països europeus, que seran els primers a provar l’eina dins de la seva rutina clínica: el Vall d’Hebron Institut d’Oncologia (VHIO), l’Institut Gustave Roussy de París, el Leon Berard Centre de Lutte Contre de Cancer de Lion, l’Uniklinik RWTH AACHEN i l’Uniklinik KÖLN d’Alemanya, el Manchester Research Cancer Centre, l’Institut d’Investigacions Biomèdiques de Girona Dr. Josep Trueta, la Xarxa Assistencial Universitària de Manresa Althaia i el Servei Andalús de Salut, així com l’Institut Català d’Oncologia (ICO) i la Fundació Progrés i Salut de la Junta d’Andalusia.
Com a centres de recerca, a més de l’IRB Barcelona, també és soci del projecte el Centre Nacional d’Anàlisi Genòmica (CNAG – CRG). L’empresa Alira Health és el soci encarregat de vetllar per tota la part regulatòria i l’European Association for Cancer Research gestionarà les accions de comunicació associades al projecte.
Un pilar clau d’aquest projecte és la participació de les persones amb càncer. Els socis del projecte, la Coalició Europea de Pacients amb Càncer i l’Associació Espanyola Contra el Càncer, representaran la societat i els pacients.
Participació del pacient
El projecte té com a objectiu involucrar els pacients amb càncer perquè puguin exercir un paper actiu en el procés del seu propi tractament personalitzat contra el càncer. A aquest efecte, l’eina final d’interpretació del genoma creada pel projecte també proporcionarà als pacients un informe que podran discutir amb el metge, informant-los sobre les característiques moleculars del tumor i el que això significa per al tractament.
El projecte també cerca ressaltar el valor de la informació i conscienciar els pacients que poden ajudar a millorar el sistema acceptant compartir els detalls moleculars dels seus tumors i la seva informació clínica. En la seva versió actual, els algorismes del Càncer Genome Interpreter s’han desenvolupat a partir de l’anàlisi dels genomes dels tumors de 28.000 pacients, que abasten més de 66 tipus de càncer, que són a disposició de la comunitat científica en repositoris públics. A mesura que s’afegeixin nous tumors seqüenciats en el transcurs del projecte, els mètodes d’aprenentatge automàtic milloraran les prediccions, cosa que millorarà la interpretació de les mutacions tumorals per als nous pacients.
Segueix el progrés del projecte
La reunió de llançament va marcar la pauta per a aquest emocionant i ambiciós projecte, i tots els socis estan molt motivats per aconseguir l’objectiu principal de dur a terme una iniciativa comunitària per fomentar la implementació de la medicina oncològica de precisió als hospitals, en benefici de els pacients amb càncer.
Per a mantenir-te al dia del progres de CGI-Clinics durant els propers anys. Segueix el projecte a les xarxes socials: Twitter, Facebook, LinkedIn i Instagram
CGI-Clinics is funded by the European Union. Views and opinions expressed are however those of the author(s) only and do not necessarily reflect those of the European Union or the European Health and Digital Executive Agency (HADEA). Neither the European Union nor the granting authority can be held responsible for them.