Ramon Amat
ramat@vhio.net
Puesto actual
Investigador sénior responsable del Laboratorio de Genómica Traslacional en tumores torácicos del Grupo de Tumores Torácicos
Formación académica
- Doctorado en Bioquímica y Biología Molecular, Universidad de Barcelona, 2009. Tesis: Papel de sirti1 en el control transcripcional de genes clave del metabolismo energético muscular
- Licenciado en Biología, Universidad de Barcelona, 2004.
Resumen curricular
Realicé mi tesis doctoral en la Universidad de Barcelona en el laboratorio del dr. Francisco Villarroya, donde estudié el papel de Sirt1 en la regulación transcripcional de genes importantes por el metabolismo energético. Al finalizar mi tesis, fui a formarme a Nueva York. Primero, un año en el laboratorio de la Dra. Lorraine Gudas donde estudié el papel de receptores de ácido retinoico en la diferenciación de células madre. También en Nueva York, en el laboratorio del dr. Robert Fisher estudié el rol de las Cyclin-dependiente kinasas en la regulación de la transcripción y también como dianas en cáncer colorrectal. Después de 4 años en EEUU, volví a Barcelona, al laboratorio del dr. Francesc Posas (UFP/PRBB), donde lideré dos líneas de investigación sobre el estrés celular. Por un lado, el impacto del estrés en la conformación de la cromatina, y por el otro hice un cribado masivo (utilizando CRISPR/Cas9) para identificar nuevos genes esenciales de respuesta a estrés.
En 2019, empecé a trabajar en VHIO como investigador asociado del laboratorio de Genómica Traslacional de Tumores Torácicos bajo el paraguas de la Dra. Enriqueta Felip, y desde 2023 soy Investigador Senior. Como responsable del laboratorio lidero, diferentes proyectos traslacionales centrados en el estudio de biomarcadores moleculares de respuesta a nuevas terapias en cáncer de pulmón, mediante la caracterización de muestras de pacientes utilizando diferentes técnicas “ómicas”.
Premios y becas
- 2014 Marie-Curie Cofund Program (Universitat Pompeu Fabra/European Commission).
- 2011 Beatriu de Pinós (Fase I i II) (Generalitat de Catalunya).
- 2005 Formación Personal Universitario (FPU), Ministerio de Educación y Ciencia
Proyectos
- 2023-2025 Proyectos de I+D+I en Salud (Instituto de Salud Carlos III). Dissecting the role of somatic copy number alterations as a molecular biomarker in NSCLC.
Publicaciones científicas más relevantes
- Carbonell C, Frigola J, Pardo N, Callejo A, Iranzo P, Valdivia A, Priano I, Cedrés S, Martinez-Marti A, Navarro A, Lenza L, Soleda M, Gonzalo-Ruiz J, Vivancos A, Sansó M, Carcereny E, Morán T, Amat R*, Felip E*. Dynamic changes in circulating tumor DNA assessed by shallow whole-genome sequencing associate with clinical efficacy of checkpoint inhibitors in NSCLC. Mol Oncol. 2023 Feb 28. doi: 10.1002/1878-0261.13409 *co-autors de correspondència
- Frigola J, Carbonell C, Irazno P, Pardo N, Callejo A, Cedres S, Martinez-Marti A, Navarro A, Soleda M, Jimenez J, Hernandez-Losa J, Vivancos A, Felip E, Amat R. High levels of chromosomal aberrations negatively associate with benefit to checkpoint inhibition in NSCLC. J Immunother Cancer. 2022 Apr;10(4):e004197. doi: 10.1136/jitc-2021-004197.
- Serra SA, Stojakovic P, Amat R, Rubio-Moscardo F, Latorre P, Seisenbacher G, Canadell D, Böttcher R, Aregger M, Moffat J, de Nadal E, Valverde MA, Posas F. LRRC8A-containing chloride channel is crucial for cell volume recovery and survival under hypertonic conditions. Proc Natl Acad Sci U S A. 2021 Jun 8;118(23):e2025013118. doi: 10.1073/pnas.2025013118.
- Frigola J, Navarro A, Carbonell C, Callejo A, Iranzo P, Cedrés S, Martinez-Marti A, Pardo N, Saoudi-Gonzalez N, Martinez D, Jimenez J, Sansano I, Mancuso FM, Nuciforo P, Montuenga LM, Sánchez-Cespedes M, Prat A, Vivancos A, Felip E*, Amat R*. Molecular profiling of long-term responders to immune checkpoint inhibitors in advanced non-small cell lung cancer. Mol Oncol. 2021 Apr;15(4):887-900. doi: 10.1002/1878-0261.12891. *co-autor de correspondència.
- Amat R, Böttcher R, Le Dily F, Vidal E, Quilez J, Cuartero Y, Beato M, de Nadal E, Posas F. Rapid reversible changes in compartments and local chromatin organization revealed by hyperosmotic shock. Genome Res. 2019 Jan;29(1):18-28. doi: 10.1101/gr.238527.118. Epub 2018 Dec 6
- Kalan S*, Amat R*, Schachter MM, Kwiatkowski N, Abraham BJ, Liang Y, Zhang T, Olson CM, Larochelle S, Young RA, Gray NS, Fisher RP. Activation of the p53 Transcriptional Program Sensitizes Cancer Cells to Cdk7 Inhibitors. Cell Rep. 2017 Oct 10;21(2):467-481. doi: 10.1016/j.celrep.2017.09.056. *co-primers autors de l’estudi.
- Larochelle S, Amat R, Glover-Cutter K, Sansó M, Zhang C, Allen JJ, Shokat KM, Bentley DL, Fisher RP. Cyclin-dependent kinase control of the initiation-to-elongation switch of RNA polymerase II. Nat Struct Mol Biol. 2012 Nov;19(11):1108-15. doi: 10.1038/nsmb.2399
- Amat R, Planavila A, Chen SL, Iglesias R, Giralt M, Villarroya F. SIRT1 controls the transcription of the peroxisome proliferator-activated receptor-gamma Co-activator-1alpha (PGC-1alpha) gene in skeletal muscle through the PGC-1alpha autoregulatory loop and interaction with MyoD. J Biol Chem. 2009 Aug 14;284(33):21872-21880. doi: 10.1074/jbc.M109.022749.
