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Grupo de Ingeniería Genómica del Cáncer

Nuestro grupo estudia la función de cambios cromosómicos a gran escala conocidos como alteraciones del número de copias (CNA). Combinamos estrategias de ingeniería genómica de última generación para descubrir los mecanismos mediante los cuales los CNA permiten que las células cancerosas se propaguen y resistan las terapias. Estamos particularmente interesados ​​en el papel de estas alteraciones en la vigilancia inmune, la heterogeneidad tumoral y la evolución del genoma del cáncer. Nuestro objetivo a largo plazo es comprender la compleja biología de los CNA para identificar nuevas estrategias terapéuticas dirigidas a las células con estas aberraciones cromosómicas.

Los cánceres surgen por alteraciones genéticas y epigenéticas que provocan la transformación de células individuales en tumores malignos. Entre los cambios genéticos más frecuentes observados en el cáncer, encontramos las alteraciones del número de copias (CNA). Como su nombre indica, las CNA cambian el número de copias de regiones específicas del ADN que tiene una célula cancerosa. Es importante destacar que algunas CNA están asociadas con malos resultados clínicos, sin embargo, aún no sabemos cómo modifican las propiedades de las células cancerosas. Para comprender la función de las CNA, nuestro laboratorio combina modelos in vivo de cáncer con MACHETE, un nuevo enfoque que permite modelar las CNA.

Nuestro trabajo anterior se centró en estudiar la eliminación conjunta de un grupo de 17 interferones de tipo I vinculados a los genes supresores tumorales CDKN2A/B. Mediante el uso de MACHETE, demostramos que la pérdida combinada del grupo de interferones y los supresores tumorales condujo a la evasión inmune, la metástasis y una respuesta reducida a la inmunoterapia en comparación con las supresiones de CDKN2A/B únicamente (Barriga et al., Nature Cancer, 2022). Este estudio ilustra la compleja biología de las CNA y la necesidad de un modelado preciso para dilucidar las consecuencias biológicas de estas alteraciones. Desde una perspectiva más amplia, las CNA tienen una lógica operativa única arraigada en los cambios de la dosificación de genes y la topología del ADN, que nuestro grupo explorará en profundidad.

Francisco Barriga con bata VHIO en el laboratorio
Francisco “Pancho” Barriga
Jefe de Grupo

En el contexto de nuestra beca Starting Grant del ERC, nuestro laboratorio explorará la biología de las CNA en las siguientes áreas de investigación:

  • Comprender el papel de las CNA como mecanismos de evasión inmune.
  • Identificar el efecto de las CNA en la heterogeneidad tumoral.
  • Diseccionar la contribución de las CNA en la configuración de la evolución del genoma del cáncer.
Jefe de grupo
Francisco “Pancho” Barriga
Lab manager
Xieng Chen Wang
Becario posdoctoral
Dario Ruiz
Estudiantes de doctorado
Sofía Calpe
Matea Katić
Técnica de laboratorio
Golsa Jahangiri
  • Barriga FM. Studying large genomic deletions with MACHETE. Nat Rev Cancer. 2023 May;23(5):271.

 

“My Bibliography” at the NCBI

Título: Unraveling the function of anti-tumor immune cell states through combinatorial genetics – IMMUNE_TRACE
Referencia: CNS2023-144041
Entidad Financiadora: Agencia Estatal de Investigación. Ministerio de Ciencia e Innovación
Periodo de Ejecución: 1/04/2024-31/03/2026
PI: Francisco Barriga
Ayuda cofinanciada por la Unión Europea Next Generation EU – Plan de Recuperación Transformación y Resilencia

 

ERC Starting Grant Acronym: MACHETE
Título: Dissección de los efectos epigenéticos de la deleción del cluster MHC en cáncer de páncreas (EPI-MHC).Entidad Financiadora: Agencia Estatal de Investigación – Ministerio de Ciencia e Innovación. Referencia: PID2022-141256OA-I00. Periodo de Ejecución: 01/09/2023 – 31/08/2026. PI: Pancho Barriga

Título: Unraveling the function of anti-tumor immune cell states through combinatorial genetics – IMMUNE_TRACE
Referencia: CNS2023-144041
Entidad Financiadora: Agencia Estatal de Investigación. Ministerio de Ciencia e Innovación
Periodo de Ejecución: 1/04/2024-31/03/2026
PI: Francisco Barriga
Ayuda cofinanciada por la Unión Europea Next Generation EU – Plan de Recuperación Transformación y Resilencia

 

ERC
Edward P Evans Foundation

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