Avanzando la oncología de precisión con el análisis de datos, la IA y las herramientas digitales
El VHIO-CRIS Programa de Inteligencia de Precisión y Red de Oncología para una Evidencia e Investigación Mejoradas (PIONEER, por sus siglas en inglés) promueve la innovación en oncología de precisión y la transformación digital mediante el refuerzo de la integración y el uso compartido de datos multimodales entre todos los grupos de investigación del VHIO. Mediante la armonización y la conexión de varios conjuntos de datos, el programa mejora la aplicación de estos para asistir en la toma de decisiones y refuerza a la unidad de servicios transversales del instituto, lo cual consolida aún más el ecosistema de investigación a partir de datos del VHIO.
El programa tiene como objetivo posicionar al VHIO y a la Fundación CRIS contra el cáncer como instituciones punteras en el análisis avanzado de datos y en trabajos de investigación a gran escala que impulsen el desarrollo de nuevos tratamientos. También fomenta la creación de herramientas digitales para el diagnóstico, el pronóstico, la predicción y la prevención, con el objetivo último de mejorar la evolución clínica del paciente y mantener el liderazgo del VHIO en la investigación contra el cáncer.
El programa VHIO-CRIS PIONEER presta su apoyo al establecimiento de nuevas unidades de digitalización de datos multimodales, incluidos el Grupo de Oncology Data Science (Odyssey), la Unidad de Bioinformática, la Unidad de Estadística y la Unidad de Ingeniería de Datos para Investigación. Conjuntamente, estas unidades están ampliando las competencias del VHIO en materia de investigación oncológica a partir de datos y reforzando la posición del instituto como líder en oncología de precisión basada en IA.
Una de les principales prioridades del programa es el desarrollo de plataformas digitales para la integración, la visualización y el análisis de datos oncológicos multimodales. Estas plataformas integran datos clínicos, moleculares y de técnicas de obtención de imagen clínica –incluidas la genómica, la transcriptómica, la inmunómica, la metagenómica, la epigenómica, la radiología y la anatomopatología digital– como apoyo a la investigación traslacional, el descubrimiento de biomarcadores y la oncología de precisión.
Paralelamente, el programa promueve la creación de herramientas con tecnología de IA para el análisis avanzado de datos e imágenes médicas, como pueden ser de radiómica y anatomopatología digital, lo que permite acelerar la aplicación de la medicina de precisión.
La iniciativa también tiene como objetivo reforzar la confianza de los usuarios finales, especialmente entre los oncólogos y los investigadores biomédicos, a través de la mejora de la transparencia y la explicabilidad de los modelos empleados. Además, pretende aumentar la conciencia social en cuanto al uso responsable en investigación de los datos de los y las pacientes capacitando tanto a estos como a sus representantes y a las asociaciones relacionadas.
Gracias a su infraestructura tecnológica avanzada, el programa apoya iniciativas de investigación clave, como pueden ser:
- La investigación del impacto del exposoma en pacientes con cáncer y tumores sólidos.
- La realización de análisis a gran escala de mecanismos de evasión inmunitaria en varios tipos de cáncer.
- La realización de análisis multidimensionales (datos de la vida real) y moleculares para identificar factores causales y predictivos del cáncer.
- Los equipos de ciencia de datos, estadística, ingeniería de datos y bioinformática del VHIO han fortalecido considerablemente las competencias de investigación traslacional del instituto. La Unidad de Estadística ha participado en más de 10 ensayos clínicos, ha presentado 22 publicaciones científicas de alto impacto y ha avanzado también en la validación de biomarcadores y nuevos modelos de rentabilidad en apoyo de la atención oncológica basada en datos.
- Además, la Unidad de Ingeniería de Datos para la Investigación (DERU) ha consolidado la infraestructura de datos institucionales del VHIO mediante plataformas interoperativas que integran datos clínicos y de multiómica. Su cVHIOportal incluye actualmente 34 proyectos de investigación y contiene datos de más de 3.300 pacientes y 3.600 muestras. La DERU también ha reforzado la gobernanza de los datos, el cumplimiento de la normativa y los procesos automatizados de integración de datos, lo que posibilita un ecosistema sólido para la investigación en oncología traslacional y de precisión.
- La Unidad de Bioinformática ha ampliado sus competencias analíticas en genómica, transcriptómica, metagenómica y tecnologías de célula única con 58 estudios colaborativos y la mejora de la infraestructura computacional con recursos de GPU preparados para IA y flujos de trabajo de análisis estandarizados.
- Paralelamente, el Grupo de Oncology Data Science (ODysSey) del VHIO y el VHIR sigue desarrollando la iniciativa SYNTHIA sobre el cáncer de mama con la integración de datos clínicos, radiológicos y de anatomopatología digital a fin de posibilitar la generación de datos sintéticos y la investigación multimodal con protección de la privacidad. En conjunto, estos avances están acelerando el descubrimiento de biomarcadores, la investigación oncológica en función de los datos y la medicina de precisión con tecnología de IA de conformidad con la normativa europea de protección de datos.
Aparte de la investigación, el programa de VHIO-CRIS promueve activamente el intercambio de conocimiento, la formación y la atracción de talento. La Unidad de Bioinformática coordina una red interna dedicada a compartir conocimiento experto y a optimizar recursos.
Una de sus iniciativas de referencia, que organiza anualmente la VHIO Academy, es el Biocomputational-Bioinformatics Journal Club, un foro mensual donde los participantes debaten temas emergentes de este campo. Además, como apoyo adicional al talento joven, el programa patrocina el Premio al Trabajo de Fin de Máster en Oncología Computacional, que reconoce trabajos de investigación destacados en ciencias de la vida computacionales llevados a cabo en España.
PIONEER se ha diseñado con el objetivo de aumentar la conciencia social en cuanto al uso de los datos de los pacientes en la investigación. Nuestro objetivo es capacitar a los y las pacientes, a sus representantes y a las asociaciones relacionadas a través del aprovechamiento estratégico del programa de PACIENTES del VHIO.
Este programa pretende, por un lado, capacitar y formar a pacientes y ciudadanía en la investigación y en el conocimiento general del cáncer con el fin de que puedan tomar decisiones con conocimiento de causa. Por otro lado, al capacitar a los y las pacientes, aportamos un valor añadido a los proyectos del VHIO gracias a la introducción de la perspectiva del paciente en el diseño de los proyectos de investigación oncológica.
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