Avançant en Oncologia de Precisió amb Anàlisi de Dades, IA i Eines Digitals
El programa PIONEER (Precision Intelligence & Oncology Network for Enhanced Evidence & Research) del VHIO-CRIS promou la innovació en oncologia de precisió i la transformació digital mitjançant el reforçament de la integració i l’ús compartit dades multimodals entre tots els grups de recerca del VHIO. Mitjançant l’harmonització i la connexió de conjunts de dades diversos, el programa millora l’aplicació d’aquestes dades a fi d’assistir en la presa de decisions clíniques i reforça la unitat de serveis transversals de l’institut, cosa que permet consolidar encara més l’ecosistema de recerca basat en dades del VHIO.
El programa té com a objectiu posicionar el VHIO i CRIS Contra el Càncer com a institucions capdavanteres en anàlisi avançada de dades i en estudis de recerca a gran escala que impulsen el desenvolupament de noves teràpies. També fomenta la creació d’eines digitals per al diagnòstic, el pronòstic, la predicció i la prevenció, amb l’objectiu final de millorar l’evolució clínica dels pacients i mantenir el lideratge del VHIO en la recerca contra el càncer.
El programa PIONEER de VHIO-CRIS permet l’establiment de noves unitats de digitalització de dades multimodals, com ara el Grup d’Oncology Data Science (ODysSey), la Unitat de Bioinformàtica, la Unitat d’Estadística i la Unitat d’Enginyeria de Dades per a la Recerca. Juntes, aquestes unitats estan ampliant les prestacions del VHIO en recerca oncològica basada en dades i reforçant la posició de l’institut com a líder en oncologia de precisió a partir d’IA.
Una de les prioritats principals del programa és el desenvolupament de plataformes digitals per integrar, visualitzar i analitzar dades oncològiques multimodals. Aquestes plataformes integren dades clíniques, moleculars i de tècniques d’obtenció d’imatges –com ara de genòmica, transcriptòmica, immunòmica, metagenòmica, epigenòmica, radiologia i anatomopatologia digital– com a assistència per a la recerca translacional, el descobriment de biomarcadors i l’oncologia de precisió.
Paral·lelament, el programa promou la creació d’eines amb tecnologia d’IA per a l’anàlisi avançada de dades i imatges mèdiques, com ara de radiòmica i patologia digital, cosa que permet accelerar la implementació de la medicina de precisió.
La iniciativa també té com a objectiu reforçar la confiança dels usuaris finals, especialment entre els oncòlegs i els investigadors biomèdics, a través de la millora de la transparència i l’explicabilitat dels models utilitzats. A més, pretén augmentar la consciència social sobre l’ús responsable en recerca de les dades dels i les pacients capacitant-los, i també els seus representants i les associacions relacionades.
Gràcies a la seva infraestructura tecnològica avançada, el programa dona suport a iniciatives de recerca clau, com ara:
- La investigació de l’impacte de l’exposoma en pacients amb càncer i tumors sòlids.
- La realització d’anàlisis a gran escala dels mecanismes d’evasió immunitària en diversos tipus de càncer.
- La realització d’anàlisis multidimensionals (dades de la vida real) i moleculars per identificar factors causals i predictius del càncer.
- Els equips de ciència de dades, estadística, enginyeria de dades i bioinformàtica del VHIO han reforçat considerablement els recursos de recerca translacional de l’institut. La Unitat d’Estadística ha contribuït a més de 10 assajos clínics, ha presentat 22 publicacions científiques d’alt impacte i ha avançat també en la validació de biomarcadors, metodologies d’assaig innovadores i nous models de rendibilitat per donar suport a l’atenció oncològica a partir de dades.
- A més a més, la Unitat d’Enginyeria de Dades per a la Recerca (DERU) ha consolidat la infraestructura institucional de dades del VHIO mitjançant plataformes interoperatives que integren dades clíniques i de multiòmica. El seu cVHIOportal inclou actualment 34 projectes de recerca i conté dades de més de 3.300 pacients i 3.600 mostres. La DERU també ha reforçat la governança de dades, el compliment de la normativa i els processos automatitzats d’integració de dades, la qual cosa permet un ecosistema sòlid per a la recerca en oncologia translacional i de precisió.
- La Unitat de Bioinformàtica ha ampliat els seus recursos analítics en genòmica, transcriptòmica, metagenòmica i tecnologies de cèl·lula única amb 58 estudis col·laboratius i la millora de la infraestructura computacional amb recursos de GPU preparats per a IA i fluxos de treball d’anàlisi estandarditzats.
- Paral·lelament, el Grup Oncology Data Science (ODysSey) del VHIO i el VHIR continua desenvolupant la iniciativa SYNTHIA sobre el càncer de mama amb la integració de dades clíniques, radiològiques i de patologia digital per permetre la generació de dades sintètiques i la recerca multimodal amb protecció de la privacitat. En conjunt, aquests avenços estan accelerant el descobriment de biomarcadors, la recerca oncològica basada en dades i la medicina de precisió amb tecnologia d’IA, de conformitat amb la normativa europea de protecció de dades.
A banda de la recerca, el programa de VHIO-CRIS promou activament l’intercanvi de coneixements, formació i l’atracció de talent. La Unitat de Bioinformàtica coordina una xarxa interna dedicada a compartir coneixement expert i a optimitzar els recursos.
Una de les seves iniciatives de referència, que organitza anualment la VHIO Academy, és el Biocomputational-Bioinformatics Journal Club, un fòrum mensual en què els participants debaten temes emergents d’aquest camp. A més, per donar un suport addicional al talent jove, el programa patrocina el Premi al Treball de Fi de Màster en Oncologia Computacional, que reconeix treballs de recerca destacats en ciències de la vida computacionals duts a terme a les universitats espanyoles.
PIONEER s’ha dissenyat per augmentar la consciència social sobre l’ús de les dades dels pacients en la recerca. El nostre objectiu és capacitar els pacients, els seus representants i les associacions relacionades mitjançant l’aprofitament estratègic del programa de PACIENTS del VHIO.
Aquest programa té com a objectiu, d’una banda, capacitar i educar pacients i ciutadania en la recerca i en el coneixement general del càncer, a fi de capacitar-los per a la presa de decisions. D’altra banda, en capacitar els pacients, aportem valor afegit als projectes del VHIO amb la introducció de la perspectiva del pacient en el disseny de projectes de recerca en oncologia.
