Ramon Amat
ramat@vhio.net
Posició actual
Investigador sènior responsable del Laboratori de Genòmica Translacional en tumores toràcicos del Grup de Tumors Toràcics
Formació Acadèmica
- Doctorat en Bioquímica i Biologia Molecular, Universitat de Barcelona, 2009. Tesi: Paper de sirti1 en el control transcripcional de gens clau del metabolisme energètico muscular
- Llicenciado en Biologia, Universitat de Barcelona, 2004.
Resum Curricular
Vaig realitzar la meva tesis doctoral a la Universitat de Barcelona en el laboratori del Dr. Francesc Villarroya, on vaig estudiar el paper de Sirt1 en la regulació transcripcional de gens importants pel metabolisme energètic. Al finalitzar la meva tesis, vaig anar a formar-me a Nova York. Primer, un any al laboratori de la Dra. Lorraine Gudas on vaig estudiar el paper de receptors d’àcid retinoic en la diferenciació de cèl·lules mare. També a Nova York, al laboratori del Dr. Robert Fisher vaig estudiar el rol de les Cyclin-dependent kinases en la regulació de la transcripció i també com a dianes en càncer colorectal. Després de 4 anys als EEUU, vaig tornar a Barcelona, al laboratori del Dr. Francesc Posas (UFP/PRBB), on vaig liderar dues línies de recerca sobre l’estrès cel·lular. Per un costat, l’impacte de l’estrès en la conformació de la cromatina, i per l’altre vaig fer un cribatge massiu (utilitzant CRISPR/Cas9) per identificar nous gens essencials de resposta a estrès.
Al 2019, vaig començar a treballar al VHIO com a investigador associat del laboratori de Genòmica Traslacional de Tumors Toràcics sota el paraigües de la Dra. Enriqueta Felip, i des del 2023 en soc Investigador Sènior. Com a responsable del laboratori lidero diferents projectes traslacionals centrats en l’estudi de biomarcadors moleculars de resposta a noves teràpies en càncer de pulmó, mitjançant la caracterització de mostres de pacients utilitzant diferents tècniques “òmiques”.
Premis i beques
- 2014 Marie-Curie Cofund Program (Universitat Pompeu Fabra/European Commission).
- 2011 Beatriu de Pinós (Fase I i II) (Generalitat de Catalunya).
- 2005 Formació Personal Universitari (FPU), Ministeri d’Educació i Ciència
Projectes
- 2023-2025 Proyectos de I+D+I en Salud (Instituto de Salud Carlos III). Dissecting the role of somatic copy number alterations as a molecular biomarker in NSCLC.
Publicacions més rellevants
Carbonell C, Frigola J, Pardo N, Callejo A, Iranzo P, Valdivia A, Priano I, Cedrés S, Martinez-Marti A, Navarro A, Lenza L, Soleda M, Gonzalo-Ruiz J, Vivancos A, Sansó M, Carcereny E, Morán T, Amat R*, Felip E*. Dynamic changes in circulating tumor DNA assessed by shallow whole-genome sequencing associate with clinical efficacy of checkpoint inhibitors in NSCLC. Mol Oncol. 2023 Feb 28. doi: 10.1002/1878-0261.13409 *co-autors de correspondència
Frigola J, Carbonell C, Irazno P, Pardo N, Callejo A, Cedres S, Martinez-Marti A, Navarro A, Soleda M, Jimenez J, Hernandez-Losa J, Vivancos A, Felip E, Amat R. High levels of chromosomal aberrations negatively associate with benefit to checkpoint inhibition in NSCLC. J Immunother Cancer. 2022 Apr;10(4):e004197. doi: 10.1136/jitc-2021-004197.
Serra SA, Stojakovic P, Amat R, Rubio-Moscardo F, Latorre P, Seisenbacher G, Canadell D, Böttcher R, Aregger M, Moffat J, de Nadal E, Valverde MA, Posas F. LRRC8A-containing chloride channel is crucial for cell volume recovery and survival under hypertonic conditions. Proc Natl Acad Sci U S A. 2021 Jun 8;118(23):e2025013118. doi: 10.1073/pnas.2025013118.
Frigola J, Navarro A, Carbonell C, Callejo A, Iranzo P, Cedrés S, Martinez-Marti A, Pardo N, Saoudi-Gonzalez N, Martinez D, Jimenez J, Sansano I, Mancuso FM, Nuciforo P, Montuenga LM, Sánchez-Cespedes M, Prat A, Vivancos A, Felip E*, Amat R*. Molecular profiling of long-term responders to immune checkpoint inhibitors in advanced non-small cell lung cancer. Mol Oncol. 2021 Apr;15(4):887-900. doi: 10.1002/1878-0261.12891. *co-autor de correspondència.
Amat R, Böttcher R, Le Dily F, Vidal E, Quilez J, Cuartero Y, Beato M, de Nadal E, Posas F. Rapid reversible changes in compartments and local chromatin organization revealed by hyperosmotic shock. Genome Res. 2019 Jan;29(1):18-28. doi: 10.1101/gr.238527.118. Epub 2018 Dec 6
Kalan S*, Amat R*, Schachter MM, Kwiatkowski N, Abraham BJ, Liang Y, Zhang T, Olson CM, Larochelle S, Young RA, Gray NS, Fisher RP. Activation of the p53 Transcriptional Program Sensitizes Cancer Cells to Cdk7 Inhibitors. Cell Rep. 2017 Oct 10;21(2):467-481. doi: 10.1016/j.celrep.2017.09.056. *co-primers autors de l’estudi.
Larochelle S, Amat R, Glover-Cutter K, Sansó M, Zhang C, Allen JJ, Shokat KM, Bentley DL, Fisher RP. Cyclin-dependent kinase control of the initiation-to-elongation switch of RNA polymerase II. Nat Struct Mol Biol. 2012 Nov;19(11):1108-15. doi: 10.1038/nsmb.2399
Amat R, Planavila A, Chen SL, Iglesias R, Giralt M, Villarroya F. SIRT1 controls the transcription of the peroxisome proliferator-activated receptor-gamma Co-activator-1alpha (PGC-1alpha) gene in skeletal muscle through the PGC-1alpha autoregulatory loop and interaction with MyoD. J Biol Chem. 2009 Aug 14;284(33):21872-21880. doi: 10.1074/jbc.M109.022749.
