19th Ave New York, NY 95822, USA

Grup d’Enginyeria Genòmica del Càncer

El nostre grup estudia la funció dels canvis cromosòmics a gran escala coneguts com alteracions en el nombre de còpies (CNA, per les seves sigles en anglès). Combinem estratègies d’enginyeria del genoma d’última generació amb models in vivo de càncer per descobrir els mecanismes a través dels quals les CNA permeten que les cèl·lules canceroses es reprodueixin i resisteixin els tractaments. Ens interessa especialment el paper d’aquestes alteracions en la immunovigilància, l’heterogeneïtat tumoral i l’evolució del genoma del càncer, El nostre objectiu a llarg termini és entendre la biologia complexa de les CNA per poder trobar noves estratègies terapèutiques dirigides a les cèl·lules que presenten aquestes aberracions cromosòmiques.

Els càncers es produeixen per alteracions genètiques i epigenètiques que afavoreixen la transformació de cèl·lules individuals en tumors malignes. Entre els canvis genètics més freqüents observats en càncer hi ha les alteracions en el nombre de còpies (CNA). Tal com indica el seu nom, les CNA canvien el nombre de còpies de regions específiques d’ADN que té una cèl·lula cancerosa. Cal destacar que algunes CNA es relacionen amb resultats clínics deficients, però encara no sabem com canvien les propietats de les cèl·lules canceroses. Per tal d’entendre la funció de les CNA, el nostre laboratori combina models in vivo de càncer amb MACHETE, un enfocament nou que permet introduir alteracions en el nombre de còpies.

El nostre treball anterior es va centrar a estudiar la codeleció d’un clúster de 17 interferons de tipus I relacionats amb els gens supressors de tumors CDKN2A/B. Amb l’ús de MACHETE vam demostrar que la pèrdua combinada del clúster d’interferons i dels supressors de tumors va causar immunoevasió, metàstasi i una resposta reduïda a la immunoteràpia en comparació amb les delecions de només els gens CDKN2A/B (Barriga, Tsanov et al., Nature Cancer, 2022). Aquest estudi mostra la complexa biologia de les CNA i la necessitat de models precisos per dilucidar les conseqüències biològiques d’aquestes alteracions. Des d’una perspectiva més àmplia, les CNA tenen una lògica operativa única arrelada en els canvis de dosi gènica i la topologia de l’ADN que el nostre grup estudiarà en profunditat.

Francisco Barriga con bata VHIO en el laboratorio
Francisco “Pancho” Barriga
Cap de Grup

En el marc de la subvenció ERC Starting Grant, el nostre laboratori estudiarà la biologia de les CNA en les àrees de recerca següents:

  • Entendre el paper de les CNA com a mecanismes d’immunoevasió.
  • Descobrir l’efecte de les CNA en l’heterogeneïtat tumoral.
  • Analitzar la contribució de les CNA en la determinació de l’evolució del genoma del càncer.
Cap de Grup
Francisco “Pancho” Barriga
Cap de laboratori
Xieng Chen Wang
Becari postdoctoral
Dario Ruiz
Estudiants de doctorat
Sofía Calpe
Matea Katić
Tècnica de laboratori
Golsa Jahangiri
  • Barriga FM. Studying large genomic deletions with MACHETE. Nat Rev Cancer. 2023 May;23(5):271.

“My Bibliography” at the NCBI

Título: Unraveling the function of anti-tumor immune cell states through combinatorial genetics – IMMUNE_TRACE
Referencia: CNS2023-144041
Entidad Financiadora: Agencia Estatal de Investigación. Ministerio de Ciencia e Innovación
Periodo de Ejecución: 1/04/2024-31/03/2026
PI: Francisco Barriga
Ayuda cofinanciada por la Unión Europea Next Generation EU – Plan de Recuperación Transformación y Resilencia

 

ERC Starting Grant Acronym: MACHETE
Títol: Dissecting the epigenetic effects of MHC cluster deletion in pancreas cancer (EPI-MHC). Entitat finançadora: Agencia Estatal de Investigación – Ministerio de Ciencia e Innovación. Ref: PID2022-141256OA-I00. Duració:01/09/2023 – 31/08/2026. PI: Pancho Barriga

Título: Unraveling the function of anti-tumor immune cell states through combinatorial genetics – IMMUNE_TRACE
Referencia: CNS2023-144041
Entidad Financiadora: Agencia Estatal de Investigación. Ministerio de Ciencia e Innovación
Periodo de Ejecución: 1/04/2024-31/03/2026
PI: Francisco Barriga
Ayuda cofinanciada por la Unión Europea Next Generation EU – Plan de Recuperación Transformación y Resilencia

 

ERC
Edward P Evans Foundation

Privacy Preferences
When you visit our website, it may store information through your browser from specific services, usually in form of cookies. Here you can change your privacy preferences. Please note that blocking some types of cookies may impact your experience on our website and the services we offer.